Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Top3aO70157 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top3aO70157 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Top3aO70157 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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