Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad51dO55230 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms