Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a2O55192 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a2O55192 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a2O55192 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a2O55192 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Slc6a2O55192 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a2O55192 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a2O55192 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc6a2O55192 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc6a2O55192 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc6a2O55192 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a2O55192 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc6a2O55192 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms