Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cyp26a1O55127 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cyp26a1O55127 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms