Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NlkO54949 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NlkO54949 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NlkO54949 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NlkO54949 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NlkO54949 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NlkO54949 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NlkO54949 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NlkO54949 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NlkO54949 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NlkO54949 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NlkO54949 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NlkO54949 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NlkO54949 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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