Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms