Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb10O35955 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms