Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Klf12O35738 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Klf12O35738 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms