Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Stx1aO35526 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms