Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms