Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KeraO35367 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KeraO35367 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KeraO35367 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KeraO35367 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KeraO35367 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KeraO35367 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KeraO35367 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KeraO35367 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KeraO35367 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms