Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Srsf5O35326 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf5O35326 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms