Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcns1O35173 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcns1O35173 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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