Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EllO08856 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EllO08856 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EllO08856 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EllO08856 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EllO08856 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EllO08856 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms