Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms