Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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