Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm20918J3QN17 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm20918J3QN17 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm20918J3QN17 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20918J3QN17 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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