Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubgcp6G5E8P0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms