Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28048F7BCN0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms