Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Crocc2F6XLV1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms