Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm5861F6VCN9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms