Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17728E9Q5K2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17728E9Q5K2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms