Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms