Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Ccdc171E9Q1U1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc171E9Q1U1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc171E9Q1U1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Ccdc171E9Q1U1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Ccdc171E9Q1U1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Ccdc171E9Q1U1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc171E9Q1U1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc171E9Q1U1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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