Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm20425E9Q035 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms