Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcom1E9PZ54 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gcom1E9PZ54 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms