Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm5478D3Z6R0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5478D3Z6R0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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