Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r49D3Z6L3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms