Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm4871D3Z0W7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4871D3Z0W7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms