Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ptprz1B9EKR1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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