Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apba1B2RUJ5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apba1B2RUJ5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms