Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nipsnap3aB1AWZ3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms