Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trabd2bB1ATG9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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