Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms