Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trbv26A0A0B4J1P5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trbv26A0A0B4J1P5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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