Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms