Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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