Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRP6

Gm28576, Predicted gene 28576, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28576A0A087WRP6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28576A0A087WRP6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28576A0A087WRP6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms