Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
HIF1AQ16665 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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