Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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VAMP3Q15836 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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