Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PTPRKQ15262 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRKQ15262 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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PTPRKQ15262 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRKQ15262 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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