Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMCO1Q147U7 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms