Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SCARB2Q14108 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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