Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
GRIK2Q13002 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms