Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
USP35Q9P2H5 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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