Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
FAM3DQ96BQ1 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM3DQ96BQ1 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms