Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms