Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.3 ms