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| ATP6AP1 | Q15904 | RNF2P1-201 | ENST00000442955 | 1010 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTUS2-AS2-203 | ENST00000452602 | 651 nt | TSL 3 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RBMY2UP-201 | ENST00000453474 | 324 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ARPC3P2-201 | ENST00000457786 | 533 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | PARP15-206 | ENST00000493645 | 1311 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | OR8K5-201 | ENST00000313447 | 924 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | GTSF1L-202 | ENST00000373005 | 459 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-761P-201 | ENST00000384148 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR181B1-201 | ENST00000385240 | 110 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | MTND4LP20-201 | ENST00000402379 | 270 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AP003385.6-201 | ENST00000531603 | 374 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC087242.1-201 | ENST00000536931 | 572 nt | TSL 4 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC007224.1-201 | ENST00000564410 | 144 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC136624.4-201 | ENST00000573044 | 370 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC083809.1-201 | ENST00000615051 | 472 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ZYXP1-201 | ENST00000617638 | 118 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL109620.1-201 | ENST00000618738 | 1197 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC104971.4-201 | ENST00000622763 | 249 nt | TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC109454.4-201 | ENST00000623411 | 649 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP003485.1-201 | ENST00000625093 | 753 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SMARCA2-229 | ENST00000634781 | 1106 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC099654.8-201 | ENST00000637757 | 681 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CHD9-218 | ENST00000566029 | 13110 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MAPK6PS3-201 | ENST00000403865 | 2162 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | OXR1-206 | ENST00000449762 | 2621 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ZNF33BP1-201 | ENST00000452497 | 1834 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NEB-220 | ENST00000618972 | 26307 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HSP90AA4P-202 | ENST00000506915 | 2228 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | GPR183-201 | ENST00000376414 | 1700 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MS4A5-201 | ENST00000300190 | 722 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU4-35P-201 | ENST00000362588 | 141 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-492P-201 | ENST00000363035 | 104 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1066P-201 | ENST00000363573 | 105 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | KRTAP27-1-201 | ENST00000382835 | 682 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |