Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
VAMP3Q15836 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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